一番大きな違いは、「投資信託を売った利益や分配金に対して、税金がかかるか・かからないか」です。特定口座は利益に対して20.315%の税金がかかり、NISA口座は税金がかかりません。
その他、NISA口座は年間120万円までという限度額があること(特定口座には上限はありません)、1つの金融機関でのみ利用できるなどの特徴があります。
なお、NISA口座で損失が発生したとしても、他の投資信託から生じた利益と損益通算することは出来ません。(特定口座ならできます)
特定口座について詳しくは
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